冠县位于鲁、冀、豫三省交界处，是山东省的西大门。西以漳卫河为界与河北省馆陶县、大名县相望，东隔马颊河与东昌府区为邻，南与莘县接壤，北与临清毗连。西南距河南省南乐县域仅20公里之遥。地处北纬36°22′—36°42′、东经115°16′—115°47′之间。
　　冠县县域大体呈平行四边形，南北长35里，东西宽45公里，总面积1152平方公里。 冠县县城东距聊城市区51公里，北距临清市城区55公里，南距莘县县城35公里，西至河北省馆陶县县城15公里。至济南市152公里，至北京470公里。境内公路交通，东有京九，西有京开，329国道、济聊馆高速公路和济邯铁路横贯全境。境内东部有京杭运河、马颊河，西部有漳卫河。黄河故道自斜店乡南满菜入境，境内为西南东北走向，至清水镇柳行头出境。
　　县境所处的鲁西北黄泛平原，系华北平原的一部分。其地势开阔平坦，但略有起伏。地形一般自西南向东北倾斜，地面坡降为1/6000 ～1/7000。海拔高程一般为42.5~35米，最高点在县西南部斜店乡樊楼村，高达54.8 米；最低点在县东部史庄乡花园村，仅34.6 米。由于境内历史上古黄河不断改道、决口，淤积沉淀了大量泥沙等物质，形成了岗、坡、洼相间的微地貌差异。
　　县境属温带季风区域大陆型半干旱气候，气候适宜，光照充足，四季分明。年均气温13.3℃，年均降水量549.9毫米，年均相对湿度66%，年均蒸发量2234毫米，年均干燥度1.8，年均气压1012HPA，年均风速3.4米/秒，年均日照时数4432.9小时，年无霜期日数198～227天。物候则与这种气候相对应。
　　境内河渠主要有漳卫河、马颊河、京杭运河（位山三干渠）及其漳卫河水系的长顺渠、一干渠、二干渠、三干渠、四干渠、鸿雁渠、青年渠等7条骨干渠道。另古黄河也从境内穿过。
　　境内土壤类型分潮土、盐土、沙土3种，分蒙金型、倒蒙金型、漏型、有底型、阻根型5大类土体类型，表层质地有松沙土、沙壤土、轻壤土、中壤土、重壤土等5种。土壤表层养分总趋势是缺氮、少磷、钾不足，有机质含量低。土壤平均容重1.32克/立方厘米，平均孔隙度50.3%。植被由自然植被和人工植被构成。